स्वामीनाथन को 1971 में रेमन मैग्सेसे पुरस्कार और 1986 में अल्बर्ट आइंस्टीन विश्व विज्ञान पुरस्कार से सम्मानित किया गया था। उनका पूरा नाम मनकोम्बु स्वामीनाथन था। कृषि के क्षेत्र में उनके विशेष योगदान के लिए उन्हें 1972 में भारत सरकार द्वारा पद्म भूषण से सम्मानित किया गया था।
भारत एक कृषि प्रधान देश है। लेकिन अकाल और सूखे के कारण यहां कई वर्षों तक भुखमरी के हालात पैदा हो गए। यह माना जाने लगा कि कृषि प्रधान देश में भुखमरी से कभी मुक्ति नहीं मिलेगी। लेकिन एम एस स्वामीनाथन ने देश की इस समस्या को पहचाना और इसका समाधान भी निकाला। वह गेहूं की उत्कृष्ट किस्म की पहचान करने वाले पहले व्यक्ति थे। यह मैक्सिकन गेहूं की एक किस्म थी।उनके इस कदम के बाद भारत में भुखमरी की समस्या ख़त्म हो गयी। भारत गेहूं उत्पादन में आत्मनिर्भर हो गया। यही कारण है कि स्वामीनाथन को हरित क्रांति का जनक माना जाता है।
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